Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNA1P35221 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms