Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1BP22528 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms