Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB8P17481 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms