Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C9orf85Q96MD7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms