Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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