Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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