Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NAE1Q13564 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NAE1Q13564 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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