Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KIF5AQ12840 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms