Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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