Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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