Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms