Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJC1P36383 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJC1P36383 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms