Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJB6O95452 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJB6O95452 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms