Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
WDR12Q9GZL7 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms