Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms