Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms