Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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JMJD1CQ15652 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
JMJD1CQ15652 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
JMJD1CQ15652 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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