Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms