Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED6P86452 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZBED6P86452 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms