Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP2P81877 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms