Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms