Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms