Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms