Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms