Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CBFBQ13951 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CBFBQ13951 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CBFBQ13951 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CBFBQ13951 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CBFBQ13951 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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