Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CALCOCO2Q13137 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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