Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNB3Q05901 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms