Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA5Q01523 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms