Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms