Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF3Q9ULD4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms