Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms