Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERCC4Q92889 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms