Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF4BQ92750 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms