Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms