Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC155Q8N6L0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.8 ms