Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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