Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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