Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms