Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP7AQ04656 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms