Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms