Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTAP49354 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms