Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GGCXP38435 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms