Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms