Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms