Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS1Q9NYS0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms