Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms