Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms