Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q7L0L9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q7L0L9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms