Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MTTPP55157 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MTTPP55157 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms