Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDN1P05305 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDN1P05305 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDN1P05305 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms